ITS2序列作为DNA条形码鉴定几种虎耳草科植物的有效性研究

摘要：

利用DNA条形码分子诊断技术对几种虎耳草科药用植物进行鉴定并评价ITS2序列对虎耳草科植物鉴定的有效性,为虎耳草科植物鉴定提供一种新思路.于不同区域采集13份虎耳草科植物样本,提取基因组DNA后,利用ITS2序列扩增引物进行PCR扩增及测序,并从GenBank数据库中下载11条同属及同科序列.基于HHMer注释方法去掉两端区段获得ITS2序列,采用MEGA7.0软件进行序列长度、碱基含量对比,并基于K2P模型计算并分析种内、种间遗传距离,采用邻接法构建NJ系统进化树,采用靴带检验法(1 000次重复)检验各分支的支持率,于ITS2数据库网站预测并比较ITS2序列的二级结构.结果显示,虎耳草科植物种间遗传距离大于种内遗传距离,能将各物种区分;系统进化树中各属分别聚为一支,同属内各物种大多分别聚为一小支,部分物种的鉴定需要进一步研究;各物种ITS2二级结构均存在不同差异,可对物种鉴定进行辅助分析.利用ITS2序列作为DNA条形码可有效地区分鉴别几种虎耳草科药用植物.

关键词：虎耳草科、DNA条形码、ITS2序列、分子鉴定、遗传距离

所属期刊栏目：40

分类号：R282.5(中药学)

资助基金：四川省科技厅重点研发计划;四川省科技厅省院省校科技合作重点项目;西南交通大学校级实验教学研究与改革项目

在线出版日期：2023-07-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：20-24,32