DGGE和qPCR联用定量分析环境样品中优势菌群

摘要：

精确定量环境样品中特定微生物类群的数量对阐明环境生物治理/修复过程中微生物的功能和效应具有重要意义.该文以土壤样品为例,将PCR-DGGE技术与定量PCR(qPCR)技术联用,定量检测样品中优势微生物类群数量.方法:抽提样品DNA,针对16S rDNA进行PCR-DGGE分析,明确样品中的优势菌群；再根据特定优势菌群的基因序列设计适合的定量引物,通过针对特定优势菌群的定量PCR分析,得到样品中优势菌群的数量信息.该方法灵敏度高、重复性好,并且无需培养,最大限度地保持了样品原始群落信息.

关键词：优势菌群、定量检测、DGGE、定量PCR(qPCR)

所属期刊栏目：29

分类号：X172(环境生物学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目40571145,40871217;污染控制与资源化研究国家重点实验室基金资助项目PCRRY11011;上海市城市化生态过程与生态恢复重点实验室开放基金资助2010

在线出版日期：2013-01-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：45-47,50