HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型分析

摘要：

目的 使用二代测序技术检测广州地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/丙型肝炎病毒(HCV)混合感染者和HCV感染者HCV基因型,了解本地区HCV基因型的流行特点.方法 在233例HCV感染者中,包括95例HIV/HCV混合感染者和138例HCV感染者,使用Illumina Miseq平台PE300模式对HCV Core和NS5B片段进行测序,采用生物信息学分析确定HCV基因型,对测序结果 提示混合基因型感染的样本,使用NS5A基因型特异引物进行验证.结果 HIV/HCV混合感染者静脉吸毒感染构成比显著高于HCV感染者(77.7％对19.6％P<0.001),HCV感染者输血感染的构成比显著高于HIV/HCV混合感染者(48.6％对3.2％P<0.001);HIV/HCV混合感染者HCV Core基因片段平均数据量为(15456±6689)reads,HCV感染者为(14323±5321)reads,两组无显著差异(P>0.05);HIV/HCV混合感染者HCV NS5B基因片段平均数据量为(16432±3467)reads,HCV感染者为(17611±5632)reads,也无显著差异(P>0.05);本组228例(97.9％)HCV感染者为单一HCV基因型感染,HIV/HCV混合感染者HCV 6a型和3b型感染率显著高于HCV感染者(分别为47.4％对26.8％,P=0.001和13.7％对3.6％,P=0.005),HCV 1b型感染率显著低于HCV感染者(20.0％对59.4％,P<0.001);在233例入组的HCV感染者中,发现5例(2.1％)为混合基因型感染,其中4例为HIV/HCV混合感染者,1例为HCV感染者.结论 广州地区HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型构成比存在差异,其临床意义还需要探讨.

关键词：慢性丙型肝炎、艾滋病、HCV基因型、二代测序

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资助基金：广州市卫生健康科技项目20191A011037;广州市科信局科技惠民专项2014Y2-00149

在线出版日期：2019-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：656-659