胃癌RN A结合蛋白相关预后模型的建立和验证

摘要：

目的:探讨RNA结合蛋白构建的胃癌预后模型并验证其准确性.方法:从癌症基因组图谱(CancerGenome Atlas,TCGA)数据库中下载胃癌的RNA测序数据,并测定正常组织和肿瘤组织中不同表达的RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBPs).并系统地研究及分析这些RBPs的表达和预后价值.结果:共鉴定296个不同表达的RBPs,其中166个表达上调,130个表达下调.7个RBPs(RNASE1、SETD7、BOLL、ADARB1、PPARGC1B、LARP6、MSI2)被鉴定为与预后相关的hub基因.基于以上基因构建的预后模型显示,高风险亚组患者总体生存期(OS)较低风险亚组患者低(P<0.05).在train组中,预后模型的ROC曲线下的面积为0.730,test组中为0.653.列线图和HPA数据库进一步验证了胃癌和正常组织中7个关键RBPs的表达差异.结论:胃癌的RN A结合蛋白相关预后模型显示了良好的预后鉴别能力,它将有助于揭示胃癌的发病机制并提供新的临床诊疗思路.

关键词：胃癌;RN A结合蛋白;总体生存率;预后模型;生物信息学

所属期刊栏目：30

分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：安徽省中央引导地方科技发展专项项目;皖南医学院重点科研项目

在线出版日期：2022-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：652-659