基于基因芯片技术初步探讨NAT2与晚期胆管癌预后的相关性

摘要：

目的:寻找与胆管癌预后密切相关的关键基因,探索该基因与胆管癌预后的临床相关性.方法:在GE O数据库中检索胆管癌表达谱芯片,通过GE O2 R分析得到在不同芯片数据中均差异表达的关键基因,将差异基因利用DAVID数据库进行GO生物学过程富集分析和KEGG通路富集分析,并利用TCGA数据库及OncoLnc在线生存分析明确差异基因与胆管癌预后的关系,通过临床数据验证这一相关性,并由STRING数据库对可能机制进行探索,为后续研究提供方向.结果:检索到3个胆管癌相关基因芯片,通过差异分析得到127个基因在3个基因芯片中均有差异表达,GO富集及KEGG通路分析显示差异基因主要参与氧化还原、细胞色素P450途径、叶酸代谢等过程,TCGA、OncoLnc在线生存分析提示NAT2与胆管癌预后密切相关.收集临床经晚期标准化疗的胆管癌患者组织及血液学样本38例,采集临床数据并送检SNP基因测序,结果显示NAT2突变型的疾病控制率为76.19％,显著高于野生型的35.29％,差异有统计学意义(P<0.05),提示突变型NAT2预后较好.利用STRING数据库对NAT2基因进行蛋白互作分析,推测NAT2、CYP2E1、p53三者之间存在交互作用影响胆管癌的预后,但具体机制尚不明确,有待进一步研究.结论:N A T2不同基因型与胆管癌预后关系密切,N A T2突变型患者预后较好,但其作为临床预测指标的可行性及具体作用机制尚需进一步研究.

关键词：基因芯片、NAT2、胆管癌、预后

所属期刊栏目：28

分类号：R735.8(肿瘤学)

资助基金：上海市卫生健康委员会科研课题青年编号:20194Y0263

在线出版日期：2020-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：4128-4135