原癌基因Bmi-1 B细胞抗原表位及HLAⅠ类限制性CTL表位的生物信息学分析

摘要：

目的:预测原癌基因Bmi-1(B-cell-specific Moloney murine leukemia virus insertion site 1)的B细胞抗原表位及HLA I类限制性细胞毒性T细胞(cytotoxic T cell)表位.方法:采用Ellipro(http://tools.immu-neepitope.org/ellipro/)预测Bmi-1蛋白中可能存在的线性B细胞表位和构象B细胞表位;采用ProtParam、NetCTL等软件和方法预测Bmi-1中可能存在的HLA I类限制性CTL表位.结果:Bmi-1蛋白中含有6个线性B细胞表位和8个构象B细胞表位;结合HLA结合力、蛋白酶体切割效率和TAP转运效率,经过NetCTL程序预测表明:针对不同的HLA I类分子,原癌基因Bmi-1中都存在多个HLA I类分子的限制性CTL表位.结论:综合运用多个程序预测了原癌基因Bmi-1中的B细胞抗原表位及HLA I类分子的限制性CTL表位,为下一步开展针对Bmi-1的免疫靶向治疗等研究打下了基础.

关键词：HLAI类分子、B细胞表位、CTL表位、Bmi-1

所属期刊栏目：26

分类号：R730.51(肿瘤学)

资助基金：广东省教育厅科技创新项目2015KTSCX110;广东省教育厅青年项目2015KQNCX127;广州市科技计划项目201508020262

在线出版日期：2018-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1332-1336