EGFR突变肺癌中长链非编码RNA表达谱的生物信息学分析及高表达lncRNA CR749465的验证

摘要：

目的:探讨及分析EGFR突变肺癌中差异表达长链非编码RNA的表达谱及分析其功能.方法:从NCBI公共数据平台GEO下载肺癌基因芯片数据GSE31210,获得127例EGFR突变肺癌和20例正常组织的基因表达谱数据,R软件包处理获得差异表达的lncRNA.并用荧光定量PCR法检测19对EGFR突变肺癌患者和癌旁标本,验证候选基因lncRNA CR749465的差异表达.利用DAVID分析候选lncRNA相关靶基因的GO分类及pathway通路.结果:GSE31210芯片数据分析显示,127个基因在EGFR突变肺癌组织出现差异表达,其中上调的有96个,下调的有31个.经荧光定量 PCR验证,候选基因lncRNA CR749465基因表达情况与芯片数据分析结果一致.结论:EGFR突变肺癌中存在明显的lncRNAs差异性表达,通过GO及KEGG分析发现,CR749465可能在EGFR突变肺癌的发生和发展中发挥重要作用.

关键词：表皮生长因子受体、长链非编码RNA、非小细胞肺癌、基因芯片

所属期刊栏目：25

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：山东省中青年科学家科研奖励基金BS2010YY014

在线出版日期：2017-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：1537-1539