新疆两典型微咸水湖水体免培养古菌多样性

摘要：

微咸水湖是湖泊演化过程中的一个重要中间状态,以新疆两典型微咸水湖-赛里木湖和柴窝堡湖水为研究对象,采用微孔滤膜收集菌体,SDS-酚-氯仿抽提法直接提取湖水总DNA,利用古菌16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增,分别构建两湖古菌16S rRNA基因克隆文库.用限制性内切酶HaeⅢ对随机挑选的阳性克隆子进行酶切分型,分别得到7个和8个可操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs),两文库覆盖率均大于98％.BLAST比对和系统发育分析表明赛里木湖全部克隆子归属于泉古菌门(Crenarchaeota),97％的克隆子与不同环境免培养氨氧化泉古菌有较高的序列相似性(＞97％).柴窝堡湖水古菌归为3个门:Thaumarchaeota (81.2％)、广古菌门(Euryarchaeota)(13％)和泉古菌门(Crenarchaeota)(5.8％),81.2％的克隆子与具有氮代谢功能的氨氧化古菌纯培养物具有较高的序列相似性(97％-98％),13％的克隆子与已分离到的产甲烷古菌序列同源性大于97％.研究发现新疆微咸水湖可能存有大量新划分的古菌Thaumarchaeota门类群、可培养氨氧化及产甲烷古菌类群,两典型微咸水湖泊中古菌类群多样性较低且群落组成差异大.

关键词：微咸水湖、古菌、16S rRNA基因

所属期刊栏目：32

分类号：P93;S15

资助基金：新疆特殊环境微生物实验室开放课题XJYS0203-2009-06

在线出版日期：2015-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：6811-6818