双壳纲贝类18S rRNA基因序列变异及系统发生

摘要：

双壳纲贝类栖息于环境多变的海域,是一个形态学和生态学都具有多样性的类群,清晰而可靠的进化关系对于养殖与相关种类的管理具重要意义.然而,目前对双壳类宏观分子系统学研究的报道较少.研究用18S rRNA基因(18S)分析了双壳类3个亚纲贝类的系统发育关系.从GenBank下载帘蛤目、海螂目、贻贝目、胡桃蛤目、蚶目、珍珠贝目6个目94个种类的18S全/部分序列107个,通过ClustalX软件进行序列比对,用MEGA4.1软件和PHyML软件计算遗传距离,构建系统发育树,研究了双壳类18S变异规律及其在系统发生研究中的应用.结果显示18S有插入/缺失序列,存在长度多态性.序列比对显示有5段约30 70bp的保守区,4段约130 550bp的高变区.碱基组成平均为T:24.4%,C:23.6%,A:24.5%,G:27.5%.G+C含量为51.1%.在1796个比对位点中,变异位点占31.7%,简约信息位点占24.0%.目内科间遗传距离为0.003 0.043,目间遗传距离为0.026 0.093.NJ树和ML树显示贻贝目、珍珠贝目、胡桃蛤目、蚶目和海螂目的缝栖蛤科先分别聚为支持率很高(BPN=94 100)的单系支,后聚为一大支(BPN=100).蛤蜊科与帘蛤目的其他科分离形成一置信度很高的单系支(BPN=93).帘蛤科种类聚为置信度较低(BPN=60)的一支.海螂目、帘蛤目的种类没能完全聚到所属支系,彼此嵌套,缝栖蛤科的种类从海螂目中分离出来.18S资料揭示帘蛤目的蛤蜊科、海螂目的缝栖蛤科已经进化为独立的支系.

关键词：双壳纲、18S rRNA、基因、序列分析、系统发生

所属期刊栏目：31

分类号：S18;S93

资助基金：江苏省自然科学基金项目BK2007066;江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题2005HS009,2009HS13;江苏省教育厅自然科学基金项目05SJD240028

在线出版日期：2015-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1393-1403