东北太平洋深海沉积物细菌多样性

摘要：

采用两种方法提取中国结核合同区东区沉积物不同层次总DNA,通过克隆测序构建了含有79个克隆子的细菌16S rRNA基因文库,分析了该海域沉积物中细菌的多样性.79个克隆在系统发育树中形成了11个大分支,包括Gamma proteobacteria(22.8%),Alpha proteobacteria(16.5%),Planctomycetacia(7.6%),Delta proteobacteria(6.3%), Nitrospira(6.3%),Actinobacteria(6.3%),Beta proteobacteria(5%),Acidobacteria(5.1%),Sphingobacteria(3.8%),Firmicutes(2.5%),Other bacteria(17.7%),其中Gamma proteobacteria在总文库中所占比例最高,该分支细菌在0～2cm、4～6cm层也是优势菌种.Gamma proteobacteria中假单胞菌(Pseudomonas)为优势属(22.2%).各个层次中所含细菌类群有所不同,Alpha proteobacteria、Gamma proteobacteria、Delta proteobacteria 、Planctomycetacia、Nitrospira 、Actinobacteria和Acidobacteria为三层样品共有类群.

关键词：多金属结核合同区、深海沉积物、细菌多样性、16S rRNA

所属期刊栏目：28

分类号：Q16;Q178;Q938(保护生物学)

资助基金：中国大洋矿产资源研究开发协会专项基金DYXM115-01-3-01;DYXM115-01-3-02

在线出版日期：2008-05-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：479-485