罗氏沼虾急性低温应激响应的转录组分析

摘要：

为探究罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)急性低温应激响应的基因表达模式,研究以罗氏沼虾成虾为研究对象,分别设置实验组(16℃)和对照组(24℃),实验组从24℃急性降温(2℃/1h)至16℃后的0、1h、3h、6h、12h、24h和回温至24℃后共7个时间点采集肝胰腺组织进行转录组测序分析.差异表达基因(DEGs)筛选结果显示,胁迫3h与回温后的DEGs数量(5062个)几乎是1h与回温后的1.5倍(3516个),随着胁迫时间的延长,各时间点与回温后的DEGs数量逐渐降低.KEGG富集发现,DEGs显著富集在溶酶体、淀粉和蔗糖代谢、抗原加工与呈递等途径中.此外,罗氏沼虾在急性低温应激下,黏着斑、ECM-受体互作、细胞色素P450对异生物质的代谢、谷胱甘肽代谢、氧化磷酸化、p53信号通路等相关基因也发生了显著变化.WGCNA分析发现各组间的共有DEGs聚类在与细胞功能及免疫相关模块和与能量物质代谢相关模块上.另外,花生四烯酸代谢信号通路中的Cytochrome P450 2L1-like基因、谷胱甘肽代谢信号通路中的NADP-specific isocitrate dehydro-genase基因及淀粉和蔗糖代谢信号通路中的Hexokinase基因等的表达量随低温应激时间增加呈先增后减的趋势.这些通路及基因可能在罗氏沼虾急性低温应激下的能量代谢及免疫调节等活动中起重要作用.研究为揭示罗氏沼虾急性低温应激响应的分子调控机制提供了基础数据.

关键词：急性低温应激、肝胰腺、转录组、差异表达基因、能量代谢、免疫调节、罗氏沼虾

所属期刊栏目：47

分类号：Q344+.1(遗传学分支学科)

资助基金：江苏省科技厅重点研发专项资金现代农业项目;国家重点研发计划;现代农业产业技术体系;浙江省农业水产新品种选育重大科技专项

在线出版日期：2023-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：581-593