圆口铜鱼亲本与子代肝脏转录组特征及对比分析

摘要：

通过Illumina HiseqTM 2000测序平台首次开展了圆口铜鱼(Coreius guichenoti)亲本与子代肝脏转录组测序并对比分析其测序结果.对转录组进行拼接和组装,共获得80688个Unigene,Unigene的长度主要分布在401—600 bp,占总Unigene的43.56%.与Nr、GO、COG、KEGG等公共数据库比对并进行功能注释,经分析圆口铜鱼亲本与子代差异表达基因共2701个,其中上调1240个,下调1461个.差异基因表达模式聚类热图显示,同一样本不同重复基因表达相似.将差异基因映射到代谢通路KEGG数据库进行富集分析,并对37个KEGG显著富集的代谢通路(P<0.05)构建其基因共表达网络,结果显示丙酸盐代谢、丙酮酸代谢、原核生物固碳途径、乙醛和二羧酸代谢、脂肪酸代谢、萜类骨架生物合成是KEGG差异表达基因的核心代谢途径,且这些基因在圆口铜鱼子代中表达量均显著上调.该结果丰富了圆口铜鱼基因组数据,并首次从分子水平比较了圆口铜鱼亲本和子代的代谢差异,同时解释了在同一循环水系统中子代不易患病的现象.

关键词：圆口铜鱼、肝脏、转录组、代谢通路网络

所属期刊栏目：44

分类号：Q173(水生生物学)

资助基金：中国水产科学研究院基本科研业务费;农业部财政专项CJDC-2017-01;西藏重点水域渔业资源与环境调查资助

在线出版日期：2020-08-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：774-780