苯酚胁迫下多刺裸腹溞实时定量PCR内参基因的筛选

摘要：

为研究苯酚胁迫下多刺裸腹溞(Moina macrocopa)相关基因的表达情况,筛选用于实时定量PCR分析的最佳内参基因.利用内参基因表达的cycle threshold(Ct值)非参数检验、GeNorm、NormFinder和Best-Keeper四种方法对β-actin、16S rRNA和12S rRNA进行分析,筛选出苯酚胁迫下多刺裸腹溞表达相对稳定的内参基因.结果 显示,从Ct值初步判定不同浓度苯酚胁迫后,多刺裸腹溞体内β-actin、16S rRNA和12S rRNA均可稳定表达,且稳定性顺序为:16S rRNA＞12S rRNA＞β-actin,从GeNorm软件分析显示内参基因的稳定性顺序为:16S rRNA=β-actin＞12S rRNA,NormFinder和Bestkeeper分析显示的稳定性顺序均为:16S rRNA＞β-actin＞12S rRNA.基于以上四种方法对三个候选内参基因的筛选,确定了16S rRNA作为多刺裸腹溞实时定量PCR的最佳内参基因,有助于提高qRT-PCR分析的准确性,为进一步研究苯酚胁迫多刺裸腹溞后目的基因功能的表达提供了基础.

关键词：多刺裸腹溞、实时定量PCR、内参基因、苯酚

所属期刊栏目：44

分类号：Q938.8(微生物学)

资助基金：环境化学与生态毒理学国家重点实验室开放基金研究课题;山西省重点研发计划社会发展领域项目

在线出版日期：2020-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：180-186