禾花鲤与建鲤肌间骨miRNAs测序与分析比较

摘要：

为了研究禾花鲤(Rice flower carp)肌间骨柔软的分子调控机制,采集禾花鲤和建鲤(Jian carp)的肌间骨进行micro RNAs(miRNAs)的高通量测序,并进行了生物信息学分析.从禾花鲤肌间骨的小RNA文库测序获得18—32 nt的高质量miRNA序列25474895条、鉴定出成熟miRNAs 595种,而从建鲤文库获得miRNA序列24625715条、成熟miRNAs 570种.表达差异分析结果显示,与建鲤相比,禾花鲤肌间骨中84个miRNAs呈上调表达、267个呈下调表达.禾花鲤下调表达的miRNAs中有7条为已报道的促进人类成骨的miRNAs,上调表达的miRNAs中有6条为已报道的抑制人类成骨的miRNAs.因此推测禾花鲤可能是通过下调表达促进成骨的miRNAs及上调表达抑制成骨的miRNAs来抑制成骨过程,从而维持其肌间骨细小及柔软的特性.研究为国内首次开展禾花鲤肌间骨发育的分子调控机制研究,为水产动物肌间骨发育的研究奠定了基础.

关键词：禾花鲤、建鲤、肌间骨、miRNAs、高通量测序

所属期刊栏目：43

分类号：Q173(水生生物学)

资助基金：广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费GXIF-2016-20;广西科技计划项目16449-0602;广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室开放课题GXKLEYLA2016-1;广西创新驱动发展专项资金课题桂AA17204080-5

在线出版日期：2019-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：757-762