用于N-连接完整糖肽鉴定的糖基化蛋白质组学数据处理方法最新研究亮点
蛋白质糖基化与疾病的发生发展密切相关,临床上使用的大多数肿瘤标志物是糖基化蛋白质.在组学层次上进行位点特异性糖型的分析对发现新型疾病标志物、提高基于蛋白质糖基化的精准医学研究水平等具有重要作用.色谱?质谱联用技术在糖蛋白的分离分析研究中得到了广泛的应用.基于液相色谱?串联质谱( liquid chromatography?tandem mass spectrometry, LC?MS/MS)的完整糖肽鉴定已成为研究蛋白质上位点特异性糖链修饰的主要手段,其主要优势在于分析过程中可以同时揭示蛋白位点与糖链修饰的信息,从而在组学层次实现规模化的蛋白糖基化分析.但是,与其他翻译后修饰相比,糖基化具有组成复杂、相对分子质量分布范围广的特点,因此完整糖肽的数据库检索空间较大.同时完整糖肽的质谱谱图较为复杂.在碰撞诱导碎裂的完整糖肽质谱谱图中,糖链产生的碎片离子强度较高,而肽段骨架碎裂不完全,产生的碎片离子强度较低,给完整糖肽的谱图解析带来了困难.因此,发展具有高灵敏度与可信度的质谱谱图鉴定方法是深度解析蛋白糖基化修饰的关键环节.
蛋白质组学、糖基化蛋白质、数据处理方法、组学数据、糖肽鉴定、完整糖肽
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Q51;R735.7;O658
2022-05-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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