玉米MYB转录因子蛋白应答干旱胁迫功能研究

摘要：

MYB转录因子是植物中最大的一类转录因子家族,MYB蛋白在抵抗非生物胁迫调控中有重要作用.基于玉米MYB转录因子家族成员,对其功能进行分析,以揭示玉米MYB转录因子家族蛋白应答干旱胁迫的功能研究.从PlantTFDB数据库获取玉米MYB转录因子的氨基酸序列以及蛋白质理化性质,利用Pfam数据库、ProtComp、SOPMA、SWISS-MODEL、MEME、MEGA11.0、TBtools等软件进行结构域识别、亚细胞定位、蛋白质二级及三级结构预测、系统进化树构建.从PlantTFDB中获取203个玉米MYB转录因子成员,按成员MYB结构域重复数目的不同,将其分为五类:MYB-related、R2R3-MYB、3R-MYB、4R-MYB及5R-MYB.理化性质分析表明,玉米MYB蛋白编码188～1 060个氨基酸;相对分子质量在20 693.7～117 692 kD之间;等电点在4.297 7～12.297 4之间.根据已知功能的筛选,玉米MYB成员中具有抗旱功能的蛋白有16个,结构以无规则卷曲为主.未知功能的玉米MYB蛋白与拟南芥构建进化树,预测有48个玉米MYB蛋白与拟南芥抗旱蛋白亲缘关系较近,表明这48个MYB蛋白可能与玉米抵抗干旱胁迫功能有关.数据库中获取的203个玉米MYB转录因子成员具有抗旱功能的有16个,结构进化保守,组织表达模式多样.根据功能预测的结果可知,有48个未知功能的MYB转录因子可能与玉米抵抗干旱胁迫相关.

关键词：玉米、MYB转录因子、干旱胁迫、功能研究

所属期刊栏目：43

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：吉林省科技发展计划项目;中央指导地方科技发展资金吉林省基础研究专项资助项目

在线出版日期：2022-09-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：100-111