节肢动物抗菌肽的生物信息学预测与分析

摘要：

抗菌肽（ Antimicrobial Peptides ，AMPs）是非特异性防御系统的重要组成部分，了解其结构、性质和功能对机体抵御外来侵害具有重要意义．本文利用生物信息学方法，结合ExPASy和NCBI两大门户网站，对截至2015年11月11日，NCBI上除昆虫纲以外的所有的节肢动物抗菌肽条目进行分类，并对其氨基酸长度、平均疏水性、跨膜结构、信号肽、螺旋区域等特征进行预测及分析．结果表明：节肢动物抗菌肽共190条，多数长度介于10-200个氨基酸；平均疏水性在0～1之间和有1个跨膜区的条目较多，最高的为锯缘青蟹的1．116666，最低的为蜡螟的－1．056757；2个或以上跨膜区的共5条，都存在于锯缘青蟹中；蝎目有最多的40个信号肽条目数，大多无螺旋区域．本研究为新型抗菌肽的合成奠定基础．

关键词：节肢动物抗菌肽、生物信息学、预测、分析

所属期刊栏目：37

分类号：Q943.1(植物学)

资助基金：吉林省科技厅发展计划项目20130206059NY．

在线出版日期：2016-08-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：135-138