基于网络药理学和分子对接研究丁香抗流感的作用机制

摘要：

目的:探讨丁香抗流感的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和既往文献筛选丁香活性成分.通过数据库SwissTarget Predictiont获得丁香活性成分的相应靶点;采用GeneCards数据库获取流感相关靶点.将二者取交集,获得共同靶点,运用Cytoscape 3.7.2构建"丁香-活性成分-靶点-疾病网络".运用String数据库构建共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI).利用Metascape进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析.用Autodock Vina 1.1.2对丁香活性成分与流感关键蛋白和流感病毒蛋白进行分子对接,并构建其作用网络.结果:从丁香-活性成分-流感靶点-流感网络中获得rhamnazin-3-O-β-D-glucopyranoside、isoquercitrin、quercetin-3-O-β-D-glucuronide、rhamnetin-3-O-β-D-glucuronide-6″-methyl、1,2,3,6-tetra-O-galloylglucose等28个丁香活性成分和MAPKs、TNF、AKT1、TP53、EGFR、CASP3、HSP90AA1等209个丁香治疗流感的靶点.GO富集分析和KEGG富集分析结果显示,丁香治疗流感主要与激活免疫反应,调控酶活性、细胞凋亡、细胞因子等生物过程和调控PI3 K-AKT、MAPK、细胞凋亡、趋化因子、甲型流感等信号通路有关.分子对接作用网络显示28个活性成分可与HA、NA、M2等多个流感病毒蛋白结合.结论:丁香可能通过多成分与多个流感病毒蛋白结合,并作用于多靶点,调控多通路,进而影响炎症反应、免疫应答、细胞凋亡和流感病毒复制,达到治疗流感的作用.

关键词：网络药理学、丁香、分子对接、流感、流感病毒、靶点、通路、机制

所属期刊栏目：17

分类号：R285(中药学)

资助基金：国家自然科学基金;广东省自然科学基金博士启动项目

在线出版日期：2022-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2263-2269