基于网络药理学-分子对接研究益气逐淤汤针对胃癌的作用机制

摘要：

目的:通过网络药理学-分子对接方法研究益气逐瘀汤针对胃癌的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医百科全书数据库(ETCM)获得益气逐瘀汤所有药物的化学成分和作用的有关靶点,通过Gene-Cards、OMIM、GEO数据库筛选出胃癌的靶点,通过运用R语言取交集进行维恩分析,对得到的靶点导入Cytoscape 3.7.2软件中,构建活性成分靶点网络,并将其导入String数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用Cytoscape 3.7.2中的Bisogenet插件进行网络拓扑分析.同时运用R语言Bioconductor平台对益气逐瘀汤治疗胃癌的潜在靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并将结果导入Cytoscape 3.7.2软件中绘图,得到KEGG网络关系图.运用分子对接软件Autodock vina,将核心靶点与活性成分对接,最后用Plmoy绘制图片.结果:共得到216个化学成分和1105疾病靶点,其中交集靶点38个.关键靶点包括IL-6、MMP9、PTGS2.GO功能分析主要与脂多糖的表达,氧化酶还原活性等有关.KEGG分析显示益气逐瘀汤治疗胃癌主要是通过IL-17、TNF、核因子κB、TLR和癌症相关信号通路发挥作用.分子对接结果显示与MMP9结合性能最好.结论:益气逐瘀汤治疗胃癌是通过多成分、多靶点来发挥作用,为进一步研究其作用机制奠定了基础.

关键词：网络药理学;分子对接;益气逐瘀汤;胃癌;作用通路;靶点;作用机制;信号通路

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分类号：R289.5;R735.2(中药学)

资助基金：北京医卫健康公益基金会医学科学研究基金项目YWJKJJHKYJJ-F3208D

在线出版日期：2022-01-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：3484-3490