青黛作用于急性幼粒细胞白血病的可视化"药靶蛋白模型"分析

摘要：

目的:目前青黛已是治疗急性幼粒细胞白血病(APL)的临床有效药物,但其分子机制与物质基础仍不明确.基于此本研究构建青黛与APL可视化药靶蛋白模型,以探究青黛作用于APL的分子机制.方法:通过GEO数据库检索APL微阵列芯片分析APL差异表达基因,使用TCMSP数据库筛选青黛活性成分,结合PubChem和SwissTargetPrediction匹配活性成分的靶基因并进行富集分析.String用于挖掘并构建APL可视化蛋白互作数据,将其读入Cytoscape,通过Centiscape实现网络拓扑分析.综合APL差异表达基因,通过Sybyl与青黛活性成分构建药靶蛋白模型.结果:筛选出3张APL微阵列芯片,164个差异表达基因,9种青黛活性成分,541个靶基因,这些靶点较多地参与细胞凋亡、药物结合、癌症途径、慢性粒细胞白血病等,这些都在APL中起重要作用.拓扑分析显示ELANE,CTSS为核心基因,将其与青黛9种活性成分进行药靶蛋白模型预测,显示靛玉红和靛蓝与核心基因结合度最佳.结论:APL是受多基因调控的复杂疾病,而青黛成分中靛玉红和靛蓝可通过结合ELANE,CTSS作用于APL的发生发展.

关键词：急性幼粒细胞白血病、青黛、药靶蛋白模型、靛玉红、靛蓝、基因、网络药理、生物信息

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分类号：R285.6(中药学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2020-07-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1692-1698,1704