基于转录组信息的坛紫菜EST-SSR标记的开发及新品系SW-81的种质鉴定

摘要：

基于坛紫菜(Pyropia haitanensis)转录组序列信息进行EST-SSR标记的开发,并利用多态性SSR标记构建DNA指纹图谱用于坛紫菜新品系SW-81的种质鉴定.结果显示:转录组数据中共检测出9 033个微卫星位点,其中三核苷酸重复类型为绝对优势基元,占比高达95％;经Primer5.0软件对微卫星位点进行引物设计,并从中随机合成187对微卫星引物进行有效性分析,最终获得92对有效引物,其中42对为多态性EST-SSR 标记,多态扩增率约为22.46％;利用开发的多态性EST-SSR标记构建了适用于5个坛紫菜品系的DNA指纹图谱,为新品系SW-81的种质鉴定提供有效的分子检测手段.上述结果表明:坛紫菜基因组中有着丰富的微卫星位点,且同一位点的基因序列在不同品系间存在变异,表现为扩增产物的多态性.基于EST-SSR标记的多态性分析可为坛紫菜种质资源的管理与鉴定提供有效的分子检测手段.

关键词：坛紫菜、EST-SSR、指纹图谱、种质鉴定

所属期刊栏目：30

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：国家科技重大专项;国家重点研发计划;国家自然科学基金;江苏省科技计划

在线出版日期：2021-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：464-474