猪Ⅱ型圆环病毒江苏株全基因进化及ORF3蛋白的生物信息学分析

摘要：

对NCBI已经登记的国内分离的PCV2江苏株(GQ358994.1)进行序列比对及进化分析,并对其ORF3编码蛋白的氨基酸序列进行生物信息学方法分析,对其组分、理化性质、跨膜结构域、二级结构、糖基化位点、磷酸化位点和B细胞抗原表位进行预测和推断.结果表明,PCV2江苏株与国内分离株序列同源性极高(＞99％),ORF3蛋白无跨膜区域,二级结构中自由卷曲含量最高,为54.81％,不含有糖基化位点,但有8个磷酸化位点.综合分析得出,ORF3蛋白具有大量的抗原决定簇.通过对ORF3蛋白进行生物信息学方法分析,为PRRSV疫苗设计提供理论基础.

关键词：PCV2、进化分析、ORF3蛋白、生物信息学

所属期刊栏目：40

分类号：S858.285.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：南京农业大学大学生创新项目SRT项目1004A04

在线出版日期：2012-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：881-885