permutation-PCA方法在病例对照关联分析中不同遗传模型下的表现

摘要：

目的 提出一种基于置换检验(permutation test)和主成分分析(PCA)的检验方法-permutation-PCA.探讨在病例对照关联分析中permutation-PCA在不同遗传模型下的表现.方法 基于"首吸飘感"对照组数据分别模拟产生7种不同遗传模型下的病例对照基因分型数据,采用permutation-PCA方法对模拟数据进行检验,并进一步用permutation-PCA方法检验"首吸飘感"基因分型实际数据.结果 Permutation-PCA方法对7种不同遗传模型假设下的模拟病例对照基因分型数据的检验结果差异均具有统计学意义(P均＜0.05).Permutation-PCA方法对于"首吸飘感"基因分型实际数据的检验结果差异具有统计学意义(P＜0.05).结论 Permutation-PCA方法对不同遗传模型假设不敏感,适用于复杂疾病关联分析中病例对照基因分型数据的研究.

关键词：关联分析、病例对照、遗传模型、主成分分析、置换检验

所属期刊栏目：47

分类号：R195.1(保健组织与事业（卫生事业管理）)

资助基金：国家自然科学基金30871392

在线出版日期：2009-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：94-97