急性冠状动脉综合征发病机制的单细胞转录组生物信息学研究

摘要：

目的 利用单细胞转录组生物信息技术挖掘急性冠状动脉综合征(ACS)发病的潜在机制.方法 从高通量基因表达数据库中下载ACS样本的单细胞转录组数据集GSE184073 作为研究对象,利用R语言的Seurat数据包对数据进行过滤和标准化,将具有相似特征基因的细胞进行聚类和注释,筛选与ACS发病相关的细胞亚群,提取差异表达基因,对差异表达基因进行富集分析,挖掘ACS发病的潜在信号通路,下载GSE54977 数据集,验证差异基因的表达并筛选ACS发病的核心基因,绘制受试者工作特征曲线评价核心基因预测ACS发病的价值.结果 过滤获得ACS样本细胞1720 个,稳定性心绞痛样本细胞1071 个,共聚类成10 个亚群,ACS样本中单核细胞占比高.筛选获得单核细胞相关的差异表达上调基因56 个,差异表达下调基因56 个.S100A8、S100A9、S100A12 是ACS发病的核心基因.差异表达基因显著富集于肿瘤坏死因子α、核转录因子κB、炎性反应等信号通路.结论 ACS与稳定性心绞痛样本细胞分布存在较大差异,单核细胞与急性冠状动脉综合征发病密切相关,是预防和治疗ACS的潜在靶细胞,S100A8、S100A9、S100A12 是ACS发病的潜在核心基因.

关键词：急性冠状动脉综合征、稳定性心绞痛、单细胞转录组、生物信息学

所属期刊栏目：44

分类号：R541.4(心脏、血管（循环系）疾病)

在线出版日期：2023-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：957-963