SIM2基因在膀胱癌组织中的表达及临床意义

摘要：

目的 利用在线生物信息数据库,组织和细胞水平实验探究SIM2基因在膀胱癌中的表达及涉及的临床意义.方法 通过UALCAN数据库分析SIM2基因在膀胱癌患者和正常膀胱组织中的表达差异,SIM2基因表达与膀胱癌患者淋巴结转移、分期、组织亚型等临床病理参数的关系;GEPIA数据库、HPA数据库、组织芯片和定量PCR技术验证SIM2基因在膀胱癌患者中的mRNA和蛋白表达差异;利用String数据库分析SIM2基因的蛋白相互作用及调控网络;Linked Omics数据库做SIM2相关分子的富集分析;TIMER和TISIDB数据库分析SIM2基因与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系.结果 UALCAN、GEPIA和HPA数据库结果显示,膀胱癌组织中SIM2基因的mRNA和蛋白水平的表达明显高于正常膀胱组织(P<0.05);UALCAN在线工具分析揭示,SIM2的表达与患者的淋巴结转移、病理类型、分期密切相关;免疫组织化学及定量PCR湿实验结果显示,SIM2蛋白和mRNA表达水平在膀胱癌组织中明显升高(P<0.05),但SIM2的表达与膀胱癌患者TNM分期和病理分级无相关性;String在线分析结果提示,与SIM2具有相互作用的蛋白涉及生物过程包括参与类泛素蛋白修饰、转录调控、蛋白水解等生物学过程;LinkedOmics富集分析表明,与SIM2正相关基因涉及TNF、NF-kappa B和JAK-STA等信号通路及多种生物学功能,包括细胞黏附分子结合,G蛋白偶联受体结合和细胞因子受体活性等;免疫细胞浸润水平显示SIM2的表达与树突状细胞等呈负相关.结论 通过在多种在线数据库及实验结果揭示SIM2基因在膀胱癌中高表达,可能为膀胱癌发生发展的重要分子靶点.

关键词：SIM2、膀胱癌、生物信息学

所属期刊栏目：43

分类号：R737(肿瘤学)

资助基金：四川省大学生创新创业训练培训项目;四川养老与老年健康协同创新中心科研项目

在线出版日期：2022-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：985-992