10.16036/j.issn.1000-2650.202312388
4种作物果糖激酶基因的鉴定与比较分析
[目的]基于全基因组序列,鉴定与分析水稻、玉米、高粱和谷子4种作物的果糖激酶(fructokinase,FRK)家族基因,明确其复制起源方式、系统发生关系、序列及表达分化特征等,为深入开展FRK基因功能研究、改良作物产量和品质等提供数据.[方法]采用基因组搜索、基因组内及组间比较等多种方法,分析4种作物FRK家族成员的基因结构、保守基序、系统进化、复制扩张和基因表达分化等.[结果]鉴定到水稻13个、玉米16个、高粱14个、谷子16个FRK基因家族成员,其中水稻11个、玉米7个、高粱12个、谷子13个基因为离散复制基因,水稻、高粱和谷子各有1对ρWGD基因,玉米有8个WGD基因(1个ρWGD基因,7个mWGD基因).该家族成员亚家族间基因结构差异大,但在亚家族内具有保守性.基因表达模式分析发现,直系同源基因间的表达模式相似,ρWGD基因对发生了明显的表达分化,而玉米物种特异的mWGD基因对的表达差异较小.[结论]探明了4种作物基因组包含的FRK家族基因,揭示了其复制起源、基因结构、序列及表达模式的演化特征.
禾本科作物、果糖激酶基因、基因复制、序列及表达分化
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S511;S513;S514;S515(禾谷类作物)
国家自然科学基金31601317
2024-09-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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