10.16378/j.cnki.1003-1111.22079
花斑裸鲤SIRT基因家族分析及低温适应性表达
花斑裸鲤是裂腹鱼亚科的代表物种之一,能够很好地适应青藏高原寒冷的环境.为探究sir-tuins(SIRT)基因家族在花斑裸鲤低温适应中的作用,笔者对SIRT基因家族的7个基因进行了生物信息学分析和基因表达研究.结果显示,花斑裸鲤SIRT基因家族的长度差异较大,序列最长的是SIRT1基因(22 885 bp),最短的是SIRT4基因(3660 bp),包含蛋白质编码区,编码304至691个氨基酸不等.通过保守结构域和基序分析发现,花斑裸鲤SIRT基因均具有Sir2保守结构域和基序,包括GAGxSx、xxPxxR、PxxxH和QNxDxLx.氨基酸理化性质预测结果表明,花斑裸鲤SIRT蛋白均为亲水性蛋白,除SIRT4之外,均是不稳定蛋白.亚细胞定位预测结果显示,SIRT蛋白主要分布于细胞质和细胞核中.通过预测蛋白质相互作用发现,SIRTs与SOD2、CAT、PPARGC1α、p53、FOXO1a和FOXO1b具有相互作用.进一步对SIRT基因在低温适应的花斑裸鲤的肝脏、脑和肌肉组织中表达进行分析,结果显示,低温下,SIRT2、SIRT4和SIRT7基因在肝脏和脑中表达显著上调,SIRT2～4、SIRT6和SIRT7基因在肌肉中表达显著上调,推测SIRT基因家族尤其是SIRT2、SIRT4和SIRT7基因在花斑裸鲤低温适应中可能具有重要作用.本试验分析了花斑裸鲤SIRT基因家族的特征,其结果可为后续SIRT基因在花斑裸鲤低温适应中功能研究提供基础.
花斑裸鲤、SIRT基因家族、基因特征与表达、低温适应
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Q786(基因工程（遗传工程）)
国家自然科学基金;青海省自然科学基金资助项目;省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室自主课题项目;青海大学青年科研基金资助项目
2024-01-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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