低盐胁迫下金乌贼转录组学分析

摘要：

为探讨低盐胁迫对金乌贼影响的分子机制,通过转录组测序技术,测定了正常盐度(30)培养和低盐胁迫(15)6 h的孵出30 d、体质量(1.3±0.3)g金乌贼幼体的转录组数据.测序共获得87 326 026条序列,经过质量剪切和从头拼接得到575 171条转录本和513 053条U nigenes.分别在NR、Swiss-Prot、KEGG、String和Pfam数据库对Unigenes进行功能注释,共获得62 485条注释结果.U nig enes包含数目较多的KEGG通路有嘌呤、嘧啶和碳代谢,PI3K-AKT、cAMP和Rap1信号通路,内吞作用,RNA转运,局灶性黏附,赖氨酸降解和泛素介导的蛋白水解等.低盐胁迫产生1923条差异表达基因,GO功能富集分析显示,一些可能与低盐胁迫相关的生物学过程如α-氨基酸、羧酸、氧乙酸、有机酸和RNA等代谢过程得到了显著富集.GO可视化分析发现,低盐胁迫对金属离子、阴离子及核苷酸结合,α-氨基酸代谢和水解酶活性等过程影响显著.KEGG通路富集分析显示,低盐胁迫6h后差异表达基因主要富集到雌激素和心肌细胞肾上腺素信号通路,类固醇生物合成,抗原加工与表达,脂肪和蛋白质消化与吸收,甘油脂质、花生四烯酸和酪氨酸代谢等信号通路上.本研究中获得的通路及基因信息可为今后开展金乌贼低盐胁迫生理机制的探讨、分子标记的挖掘和关键基因的克隆等提供技术支撑.

关键词：金乌贼、低盐胁迫、转录组测序、生物信息学分析、差异基因筛选

所属期刊栏目：39

分类号：Q753(分子遗传学)

资助基金：国家级大学生实践创新训练计划项目;江苏省研究生科研与实践创新计划项目;江苏省大学生实践创新训练计划;连云港市第五期521工程科研项目

在线出版日期：2020-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：369-380