中华鳖体表和体内菌群多样性分析

摘要：

采用16S rDNA分析方法,分别提取中华鳖体表和体内细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库.从2个文库中分别随机选取100个重组克隆子,抽提重组质粒,用Hae Ⅲ和MspⅠ限制性内切酶进行酶切,获得酶切指纹图谱,从每种图谱随机挑选克隆子测序,获得其16S rDNA部分序列,构建了系统进化树.在中华鳖体表和体内细菌克隆文库中分别包含13种和10种RFLP谱型,分别挑选了70个和60个克隆子进行测序.结果表明,中华鳖体表和体内文库克隆子分别归为15类和11类OTU,体表和体内菌群多样性较强,优势细菌类群分别为拟杆菌和变形菌,并在文库中检测到了几株益生菌和条件致病菌.

关键词：中华鳖、16S rDNA、RFLP、细菌多样性

所属期刊栏目：29

分类号：S966.5(水产养殖技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30840061;宁波大学学科项目XK0715049;宁波大学人才项目XR0713017;浙江省自然科学基金人才培养项目R305333

在线出版日期：2010-09-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：393-398