亲缘生物法生物信息技术在水产基因研究中的应用

摘要：

用Entrez、SRS等检索工具可从GenBank、EMBL等核酸序列数据库、鱼类专业数据库获取相关水产动物的基因等信息,通过电子邮件或网页填表等方式用BLAST、FASTA等序列分析软件来分析获得的信息,以鳜鱼rRNA基因为例,根据鳜鱼的分类树,按种、属、科、亚目、目、总目追级向上寻找亲缘关系较近的其它鱼类的rRNA基因,直到找到有价值的rRNA基因序列.将有价值的rRNA基因序列拼接成重叠群,根据重叠群设计引物、克隆鳜鱼的rRNA基因,获得鳜鱼的3个rRNA基因及其间隔序列.为经济动物的基因研究建立了一种亲缘生物法的生物信息学技术.

关键词：生物信息学、亲缘生物法、水产、鳜鱼、rRNA基因

所属期刊栏目：23

分类号：S966.12(水产养殖技术)

资助基金：国家自然科学基金30170737

在线出版日期：2004-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：24-26