拟南芥PAL基因家族鉴定及表达模式分析

摘要：

为研究苯丙氨酸解氨酶(PAL)作为苯丙烷类代谢途径的关键酶,在植物响应环境胁迫过程中的重要作用,本研究利用HMMER、Pfam与SMART等工具,从拟南芥全基因组中筛选获得9个PAL成员,分析其编码酶蛋白的理化性质、二级结构与保守基序等信息.同时,结合转录组与定量PCR分析PAL成员在干旱与盐胁迫条件下的表达模式.结果表明,拟南芥PAL成员的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;亮氨酸和丙氨酸为含量较高的氨基酸残基;拟南芥PAL成员含有20种不同的保守基序,其中motif6含有ASG活性位点,为所有PAL成员所共有;较多PAL成员具有光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关的顺式调控元件.转录组学与定量PCR分析发现,A T3G53260.1、A T3G53260.2与A T3G47660.1的mRNA表达水平在干旱与盐胁迫后发生显著变化,推测这3条基因可能参与拟南芥对干旱及盐胁迫的响应过程,表明PAL基因在调控植物生长发育与非生物胁迫响应过程中发挥重要作用.

关键词：拟南芥、苯丙氨酸解氨酶、基因家族、生物信息学分析

所属期刊栏目：59

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：国家自然科学基金;四川省中医药管理局项目;四川省中医药管理局项目;中央高校基本科研业务费医工结合项目;国家级大学生创新创业训练计划项目;西南交通大学个性化实验项目

在线出版日期：2023-01-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：166-172