麻疯树全植株全长均一化cDNA文库构建及EST序列分析

摘要：

以麻疯树根、茎、叶、花和果实为材料,使用DSN (duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART(switching mechanism at 5' end of RNA transcript)建库技术相结合,构建了麻疯树全植株均一化全长cDNA文库.经检测库容为1.4×106个克隆,插入片段平均长度大于1 kb.随机挑取200个克隆,利用PCR方法测得文库重组率达95％,48.95％的EST(Expressed Sequence Tag)没有同源性,显示了这些ESTs中能够发现新功能基因的可能性.与GeneBank Nr数据库中已知功能基因有较高同源性的有97条ESTs,相关同源性的已知基因分别参与基础代谢与运输、细胞构成、能量转换、辅酶代谢与运输、信号传导、翻译机翻译后的修饰折叠等过程.这是第一次以麻疯树全植株为材料构建全长均一化cDNA文库.

关键词：麻疯树、均一化全长cDNA文库、表达序列标签、库容

所属期刊栏目：48

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：“十二五”科技支撑项目2011BAD22808;自然科学基金31070301

在线出版日期：2012-01-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：935-942