人PSF蛋白结合长非编码RNA的筛选及鉴定

摘要：

通过RNA亲和层析(RNA affinity chromatograph),4种可能与人PSF(human polypyrimidine tract-binding protein-associated splicing factor,hPSF)蛋白结合的长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)片段在人黑色素瘤细胞yusac细胞核RNA文库中被筛选得到.它们分别定位于人内源性逆转座子L1PA16、MER 11C、非编码基因MALAT-1以及一个未知基因(unknown gene).紫外交联分析(UV cross-linking assay)证明在体外条件下这4种lncRNA片段均能与PSF蛋白结合；RNA免疫沉淀(RNA immunoprecipitation,RNA-IP)进一步证实在体内条件下这4种lncRNA均能与hPSF发生相互作用.最后,半定量RT-PCR表明,未知lncRNA特异高表达于人黑色素瘤细胞,其余3种lncRNA在多种人类肿瘤细胞中的丰度均较正常细胞明显升高.

关键词：人PSF蛋白、长非编码RNA、RNA亲和层析

所属期刊栏目：48

分类号：Q522(核酸)

资助基金：国家自然科学基金31000579;海南省自然科学基金310045

在线出版日期：2012-01-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：910-916