一种有效的蛋白质序列聚类分析方法

唐东明朱清新杨凡陈科

电子科技大学;

摘要：

提出了一种有效的基于仿射传播聚类算法和后处理方法的蛋白质序列聚类方法.在聚类分析蛋白质序列时,为了优化仿射传播聚类算法的聚类结果,采用后处理的方式来提高聚类结果的质量.为了度量蛋白质序列之间的相似度,给出了一种改进的无比对计算方法.在6个蛋白质序列数据集上进行对比实验,实验结果表明,所给出的方法能够有效地分析蛋白质序列.

关键词：模式识别、聚类分析、序列分析、蛋白质序列

所属期刊栏目：22

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60671033

在线出版日期：2011-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1827-1837