基于加权基因共表达网络分析食管鳞状细胞癌放化疗的敏感性基因

摘要：

目的 基于加权基因共表达网络从分子水平寻找影响食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)放化疗敏感性的枢纽基因.方法 于基因表达综合数据库(gene expression ominibus,GEO)获得接受放化疗ESCC的全基因组表达数据(GSE45670),分别构建放化疗病理学完全反应(Pathological Complete Response,pCR)组与无反应(Non Pathological Complete Response,npCR)组的加权基因共表达网络,结合关键网络模块成员基因GO和KEGG信号通路开展分析,综合分析网络模块各个节点基因连接度(degrees)、基因显著性(gene significance,GS)与网络位置(module membership,MM)三个关键网络属性,确定与ESCC放化疗敏感性密切相关的枢纽基因.结果 通过WGCNA法共获得blue、yellow、black、red、green等5个与放化疗敏感性密切相关的网络模块,筛选出MICAL2、EPHB6、COMMD8、EPS15L1、RBPMS等5个与食管鳞癌放化疗敏感性相关的枢纽基因.结论 本研究通过加权基因共表达网络分析方法共筛选出与ESCC放化疗敏感性相关的5个基因共表达网络模块及相应的5个枢纽基因,为寻找做术前放化疗敏感性评估的分子标志物及潜在的治疗靶点提供了线索.

关键词：食管、鳞状细胞癌、放疗、化疗、敏感性、基因、网络

所属期刊栏目：42

分类号：R735.1(肿瘤学)

资助基金：青海省卫计委项目2020-wjzdx-50

在线出版日期：2021-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：96-103