10.13452/j.cnki.jqmc.2017.04.003
多房棘球绦虫亮氨酰氨肽酶抗原表位的生物信息学预测#
目的 分析鉴定多房棘球绦虫亮氨酰氨肽酶(Echinococcus multilocularis leucyl aminopeptidase,EmLAP)蛋白质二级结构并预测其优势抗原表位.方法 从Gen Bank中获得多房棘球绦虫亮氨酰氨肽酶氨基酸序列,并通过生物信息学软件SOPMA分析多房棘球绦虫亮氨酰氨肽酶的蛋白质二级结构特征.进一步通过生物信息学软件IEDB、Syfpeithi、Bcepred、ABCpred预测分析多房棘球绦虫亮氨酰氨肽酶潜在的T细胞及B细胞抗原表位.结果 分析出多房棘球绦虫亮氨酰氨肽酶的蛋白质二级结构中α螺旋占比为45.42％、β折叠占比为16.57％、β转角占比为8.58％、无规则卷曲占比为29.43％.预测出亮氨酰氨肽酶具有9个T细胞潜在优势抗原表位,分别为L65-73、L75-84、L174-186、L233-240、L301-308、L333-343、L392-400、L445-454、L482-490;预测出多房棘球绦虫亮氨酰氨肽酶具有20个B细胞潜在优势抗原表位,分别为L13-22、L39-47、L75-84、L98-110、L146-154、L174-186、L183-191、L233-240、L247-254、L281-288、L295-306、L319-328、L330-337、L339-347、L392-400、L397-410、L421-428、L464-473、L493-504、L504-512.结论 通过使用生物信息学软件预测出多房棘球绦虫亮氨酰氨肽酶存在有潜在的优势抗原表位,分别为9个T细胞抗原表位和20个B细胞抗原表位,为后续多房棘球绦虫相关亮氨酰氨肽酶的抗原性研究和多表位疫苗的研制奠定了基础.
多房棘球绦虫、亮氨酰氨肽酶、生物信息学、抗原表位、T细胞表位、B细胞表位
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R392-3
青海省科技厅项目2014-ZJ-719
2018-01-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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