基于基因组学的小海绵羊肚菌环境适应研究

摘要：

本研究基于小海绵羊肚菌M12-10基因组数据库挖掘环境适应基因,探索其在高原极端环境中的适应机制.结果显示,通过KEGG注释数据库筛选出83条环境适应基因,主要涉及MAPK信号通路(60条)、磷脂酰肌醇信号系统(16条)和ABC转运蛋白类(7条).通过BLAST和文献综述将这些基因分为低温、紫外、盐等8类环境因素相关因子,其中抗逆境胁迫基因最多,为44条,抗低氧胁迫基因最少,为4条.筛选的盐基因M12-10_G01390在1 mol/L低盐浓度胁迫下表达量最低,3 mol/L高盐浓度胁迫下时表达量相对较高(0.25);低温基因M12-10_G03567在4℃胁迫下表达量最高(1.9);紫外基因M12-10_G04909在短时间(30 min)紫外照射下表达量升高(1.34),在中长(60 min、120 min)、长时间(300 min)紫外照射下,其表达量下降(均在0.25以下).本文为后续的羊肚菌在青藏高原生态环境中适应性研究提供参考.

关键词：小海绵羊肚菌、环境适应相关基因、胁迫、基因组分析

分类号：S646.7

资助基金：青海省科技厅项目2021-HZ-802

在线出版日期：2024-10-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：8-16