拟南芥全基因组范围的non-polyA lncRNA检测

摘要：

长非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt不编码蛋白质的RNA,它们在生物体内发挥重要的调控作用.Non-polyA lncRNA是lncRNA的一个重要类型.为系统鉴定植物全基因组范围的non-polyA lncRNA,该文优化了拟南芥基因组范围鉴定新型non-polyA lncRNA的RNA样本纯化和测序方法,并且比较了3种不同的方法.结果表明:链特异性的non-polyA RNA长序列测序检测灵敏度更高,可以检测到更多低表达的lncRNA和更高比率的长序列lncRNA.因此,non-polyA RNA长序列测序适用于拟南芥全基因组范围的non-polyA lncRNA检测.该方法也可用于其它物种中non-polyA lncRNA的鉴定,为探究lncRNA功能提供帮助.

关键词：长非编码RNA、测序方法、拟南芥

所属期刊栏目：54

分类号：Q752(分子遗传学)

资助基金：国家自然科学基金31100601

在线出版日期：2014-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1117-1121