基于SSR标记的山东地方鸡种遗传多样性和群体遗传结构分析

摘要：

为评估山东省地方鸡(Gallus gallus)种质资源遗传多样性现状,为山东省地方鸡种质资源管理及创新利用提供科学参考依据,本研究利用20对微卫星标记对6个山东省地方鸡种、1个培育品系以及1个省外鸡种共计480个个体进行基因分型,采用软件分析山东省地方鸡种的遗传多样性和群体遗传结构.结果表明,20个多态位点在8个群体中共检测到226个等位基因,平均每个位点11.3个,PIC为0.711.群体平均等位基因为6.625个,观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)和期望杂合度(expected heterozygosity,He)的平均值分别为0.579和0.666.分子方差分析结果显示,8个鸡群体间变异为18％,群体内变异为82％,遗传变异主要来自于群体内不同的个体间.聚类分析和主成分分析(principal coordinates analysis,PCoA)结果具有一致性,8个群体被分为3大类,济宁百日鸡(JB)、莱芜黑鸡(LH)、鲁禽鸡(LQ)、琅琊鸡(LY)、鲁西微型鸡(LL)和寿光鸡(SG)率先聚为一类,石歧杂鸡(SQ)和汶上芦花鸡(WL)均单独聚为一类.研究表明,8个群体均具有丰富的遗传多样性,分类结果与各品种地理位置分布以及相互关系基本一致,本研究为山东省地方鸡种的保护、评价及开发利用提供重要的理论依据.

关键词：山东、鸡、地方品种、微卫星、遗传多样性

所属期刊栏目：31

分类号：S831(家禽)

资助基金：山东省农业良种工程;山东省农业科学院农业科技创新工程鸡种质资源保护与共享利用;山东省农业良种工程;国家肉鸡产业技术体系项目

在线出版日期：2023-01-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：115-123