生物信息学分析IGF-2R在乳腺癌中的作用机制
目的 确定IGF-2R基因对乳腺癌的调控作用,挖掘参与乳腺癌发生发展潜在的基因及通路.方法 利用"GEOquery""idmap2.0""Limma""Clusterprolifer"等R包筛选乳腺肿瘤组织与正常组织的差异表达基因,并进行GO和KEGG分析.采用STRING、GEPIA和UALACN数据库绘制蛋白互作网络,分析IGF-2R基因与乳腺癌Hub基因的相关性,以及IGF2R表达水平与乳腺癌患者基本情况的相关性.结果 筛选得到128个上调差异表达基因,256个下调差异表达基因;IGF-2R基因与核心基因ASPM、RRM2相关性显著;IGF-2R基因表达水平在乳腺癌组织中显著降低,差异有统计学意义(P<0.05);IGF-2R表达水平与患者年龄(20~80岁)、临床分期(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)、绝经情况和淋巴结转移密切相关,差异有统计学意义(P<0.05).IGF-2R基因的表达水平仅在Luminal型(LuminalA型、Luminal B-HER2阴性型)乳腺癌中显著降低,差异有统计学意义(P<0.05).结论 IGF-2R通过与ASPM和RRM2正相关参与乳腺癌的调控作用,有望为乳腺癌的防治提供新的思路.
乳腺癌、生物信息学、胰岛素样生长因子受体2
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R66.4
内蒙古自治区自然科学基金项目2019MS08005
2023-03-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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347-352