基于添加功能位点信息的组合向量预测β-发夹模体

摘要：

一条蛋白质序列通常是用多种特征来表达的,因此使用简单的特征参数对蛋白质结构进行预测,得到的效果往往不尽人意.在前人使用过的预测β-发夹的特征参数基础上,将功能位点信息添加到特征参数中,共同输入到支持向量机和随机森林两种算法,对4070条非冗余的蛋白质链中的β-发夹模体进行了预测.支持向量机算法得到的预测精度80.2％,相关系数0.60；随机森林算法得到的预测精度83.3％,相关系数0.66.

关键词：β-发夹模体、随机森林算法、预测的二级结构信息、自相关函数、功能位点信息

所属期刊栏目：31

分类号：O175(数学分析)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30960090

在线出版日期：2013-03-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1-9