基于物化特性编码和离散增量的支持向量机方法预测酶的亚类

摘要：

从酶序列出发,提出了一种新的酶的亚类的预测方法.利用物化特性编码和离散增量得到特征向量来表示序列信息,并将这些特征向量输入支持向量机,对酶的6个家族类中各自的亚类进行分类.在Jacknife检验下,氧化还原酶,转移酶,水解酶,裂解酶,异构酶和连接酶中包含的亚类得到的预测精度分别为96.2%,99.2%,99.6%,95.3%,94.4%和97.7%.该方法得到的预测结果优于其它方法.

关键词：酶的亚类、物化特性编码、离散增量、支持向量机、Jacknife检验

所属期刊栏目：30

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：内蒙古自治区高等学校科学研究项目NJZY08059;内蒙古自然科学基金资助项目2009MS0111

在线出版日期：2011-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：11-16