蛋白质二级结构序列片段的识别

摘要：

识别蛋白质二级结构片段,实质上是从序列片段的水平上对二级结构进行预测.用离散量的方法,通过一系列的计算发现:选择氨基酸(20种氨基酸加一个空位)和其紧邻关联共同为参数,从N端截取固定长序列片段为6或7个连续氨基酸残基时,10交叉检验平均预测精度能达到75%～77%,jack-knife检验平均预测精度能达到72%;当固定长序列片段为9或10个连续氨基酸残基时,10交叉检验平均预测精度能达到82%～83%,jack-knife检验平均预测精度能达到74%～76%.

关键词：离散量方法、蛋白质二级结构、序列片段

所属期刊栏目：26

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金30560039;内蒙古自然科学基金200508010509

在线出版日期：2008-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：246-251