通用性引物RT-nPCR扩增不同基因型戊型肝炎病毒基因组的探讨

摘要：

目的:筛选戊型肝炎病毒(HEV)通用性引物,用于不同基因型HEV基因组的逆转录-巢式聚合酶链扩增(RT-nPCR).方法:在HEV序列保守区设计和合成A、B、C、D 4组引物,用于扩增已知基因型的HEV参考株和HEVIgM阳性的临床标本,探讨扩增区域最小自由能与RT-nPCR扩增效率的关系.结果:4组引物均可扩增出不同基因型HEV基因片段,但得到的PCR滴度有差异,D组引物所得滴度最高,B组最低;54份临床标本的PCR阳性率也以D组最高、B组最低.D组引物扩增区段的RNA模板最小自由能的绝对值最低,B组的最高,与PCR扩增效率相关.结论:在HEV基因组第6296～6603核苷酸之间设计的D组通用性引物可扩增不同基因型HEV以及临床标本,扩增效率高,有较高的应用价值.

关键词：戊型肝炎病毒、基因型、逆转录-巢式聚合酶链反应

所属期刊栏目：23

分类号：R373.21(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金30271231

在线出版日期：2004-06-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：141-144