湖羊lncRNA-269的鉴定及转录调控分析

摘要：

[目的]本文旨在研究湖羊长链非编码RNA-269(long no-coding RNA-269,lncRNA-269)序列特征、表达模式和转录调控,为后续开展lncRNA-269的功能研究提供理论基础.[方法]以湖羊为研究对象,采用 5′/3′RACE结合PCR扩增方法获得其序列全长,利用RT-qPCR方法鉴定其在湖羊组织中的表达模式,并利用PCR方法扩增其启动子区,鉴定其启动子区特征,分析其转录调控情况.[结果]湖羊lncRNA-269全长3 146 bp,组织表达谱显示其在湖羊各组织中广泛表达,且在健康卵泡中显著高表达,其表达水平与NR5A1 mRNA水平和血清中雌二醇(E2)水平呈正相关.荧光素酶活性分析发现在lncRNA-269 启动子区的-359～-17 nt有1个转录激活基序,在-1 485～-942 nt有1个转录抑制基序.JASPAR软件预测发现在lncRNA-269 转录抑制启动子区域存在FOXO3、PDX1等转录因子结合位点,在转录激活区域有SMAD4、YY1 等转录因子结合位点.过表达SMAD4可显著提升lncRNA-269启动子区荧光素酶活性,染色质免疫沉淀(ChIP)-PCR试验进一步确认了SMAD4 特异性与lncRNA-269启动子区结合.[结论]湖羊lncRNA-269在健康卵泡中显著高表达,其启动子区存在一个转录激活区域和一个转录抑制区域,转录因子SMAD4可通过与lncRNA-269启动子区结合显著上调lncRNA-269的启动子活性.

关键词：湖羊、卵巢卵泡、lncRNA-269、5′/3′RACE、染色质免疫沉淀(ChIP)

所属期刊栏目：47

分类号：S826(家畜)

资助基金：国家自然科学基金32102550

在线出版日期：2024-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：174-182