CIDEA基因上游调控区变异对猪肌内脂肪性状的影响

摘要：

[目的]本文旨在鉴定诱导细胞死亡DNA片段化因子α样效应因子A(CIDEA)基因上游调控区内与猪肌内脂肪沉积相关的单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析关联位点对基因表达的影响,为解析CIDEA基因对猪肌内脂肪性状的影响机制提供参考.[方法]通过对猪CIDEA上游调控区2 kb片段测序,挖掘出肌内脂肪含量相关的候选SNP位点,在杜洛克×长白猪×大白猪群体中对候选位点进行关联分析;通过荧光定量PCR检测关联位点不同基因型个体的CIDEA基因表达量和肌内脂肪标记基因脂肪酸结合蛋白4基因(FABP4)、脂肪酸结合蛋白3基因(FABP3)的表达量;双荧光素酶报告基因系统分析突变位点对CIDEA基因转录活性的影响.[结果]猪CIDEA基因上游调控区包含6个SNP位点,连锁分析后选择g.97268816 T>A、g.97269217 G>A和g.97269353 C>T 3个标签SNP位点进行关联分析,发现g.97268816 T>A位点中AA基因型个体的肌内脂肪含量显著高于TT基因型个体(P<0.05),而g.97269217 G>A和g.97269353 C>T位点中3种基因型个体之间的肌内脂肪含量差异不显著(P>0.05).g.97268816 T>A位点中AA基因型个体的CIDEA基因表达水平显著高于TT基因型个体(P<0.05),而FABP4基因表达水平则显著高于TT基因型个体(P<0.01)和TA基因型个体(P<0.05).双荧光素酶报告基因活性的结果显示AA型个体的荧光素酶活性极显著高于TT型个体(P<0.01).[结论]CIDEA基因上游调控区g.97268816 T>A位点与猪的肌内脂肪含量显著相关,突变可以导致CIDEA基因的表达水平升高,进而影响猪的肌内脂肪含量.

关键词：CIDEA、猪、肌内脂肪、变异、转录活性

所属期刊栏目：45

分类号：S813.1(普通畜牧学)

资助基金：中央高校基本科研业务费专项;国家转基因生物新品种培育重大专项;国家科技支撑计划

在线出版日期：2022-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：570-577