10.3969/j.issn.1000-2006.201908020
毛竹GeBP转录因子家族的全基因组鉴定和表达分析
[目的]通过对毛竹(Phyllostachys edulis)GeBP转录因子分子特征和表达模式的研究,为揭示其在表皮毛形成过程中的作用提供参考.[方法]通过生物信息学方法对毛竹GeBP转录因子的基因结构、蛋白基本理化性质与结构特征以及系统进化进行系统分析;采用转录组数据,对各成员基因在毛竹不同组织中的表达模式进行分析,同时利用实时定量PCR(qRT?PCR)的方法进行验证.[结果]在毛竹基因组中共鉴定出16个GeBP转录因子家族基因成员(PeGeBP1-PeGeBP16),其中仅3个基因(PeGeBP3、PeGeBP4和PeGeBP5)含有内含子,数量分别为1、1和5个.PeGeBPs编码的蛋白主要定位在细胞核内,蛋白分子质量为23.37～62.17 ku,理论等电点为5.02～10.14.系统进化分析表明,毛竹与水稻(Oryza sativa)和二穗短柄草(Brachypodium distachyum)对应的GeBP成员亲缘关系较近,分别聚类到4个分支,而与拟南芥(Arabidopsis thaliana)和毛果杨(Populus trichocarpa)的距离较远.转录组表达谱热图分析显示,除PeGeBP5在叶片中未检测到表达外,其他基因在鞭生根、茎生根、笋、叶片和箨片中均有表达,但表达丰度具有一定的差异.qRT?PCR结果表明,16个PeGeBPs在叶、笋、箨、箨片和纤毛中均检测到表达,但存在明显差异,在有表皮毛的组织(叶、箨、箨片和纤毛)中12个PeGeBPs的表达量均高于无表皮毛的笋,只有PeGeBP16在笋中表达量高于其他组织,而其他3个基因在笋中的表达量也较低.[结论]从毛竹中鉴定了16个GeBP转录因子基因,各基因在不同的组织中表达量差异明显,表明它们功能的多样性.大多数PeGeBPs(12个)的表达量在有表皮毛的组织中均高于无表皮毛的组织，表明这些基因可能参与表皮毛的形成调控.
毛竹、GeBP转录因子基因、表达模式、表皮毛
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S762(森林保护学)
“十二五”国家科技计划农村领域项目2015BAD04B0101
2020-06-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
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