拟松材线虫组织蛋白酶基因Bmcath1的序列分析与转录水平检测

摘要：

拟松材线虫组织蛋白酶基因Bmcath1是一个在松材线虫与拟松材线虫中差异表达的基因，为了解该基因的生物学功能，对Bmcath1基因进行了生物信息学分析。笔者使用BioEdit、SignalP 4．1、BLASTP、MEGA 4．0等软件对Bmcath1基因进行了生物信息学分析，发现Bmcath1 cDNA序列全长1294 bp，含有一个长度为1158 bp的开放阅读框。由Bmcath1基因编码的蛋白质CATH1含有386个氨基酸，分子质量为42?38 ku，等电点为8．52。蛋白质CATH1存在一个Peptidase＿C1A subfamily功能域结构，在不同物种上的氨基酸序列多样性丰富。采用Real?Time PCR方法对不同培养方式获得的拟松材线虫中Bmcath1基因的表达量进行检测，发现该基因在分离自黑松的拟松材线虫中高量表达，据此推测拟松材线虫Bmcath1基因可能在线虫处于松树体内生长、繁殖时发挥更为重要的作用。

关键词：拟松材线虫、组织蛋白酶、系统发育树、表达谱分析

分类号：S763.16(森林保护学)

资助基金：国家自然科学基金;江苏省高等学校自然科学研究项目;江苏高校优势学科建设工程项目

在线出版日期：2015-12-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：12-16