Alzheimer's疾病相关蛋白质相互作用网络构建及其相互作用预测

摘要：

依据无标度网络的相关理论,提出一种预测蛋白质-蛋白质相互作用的算法,并预测潜在的作用位点.收集了所有与阿尔兹海默疾病(Alzheimer's disease)相关疾病的人类蛋白,并找出与之能发生相互作用的蛋白质,绘制一个有关人类AD相关蛋白质相互作用网络.分析和计算了该网络的一些详细属性,并对网络进行生物信息学分析,找出网络中的蛋白质调控路径,该路径可能涉及到Apoptosis-antagonizing transcription factor(AATF)蛋白对于阿尔兹海默疾病的抑制作用.几个潜在与AATF蛋白作用的位点被自己开发的程序预测出,将它们的潜在作用位点做了比对,最后得到一个高度收敛的序列模体,其正则表达式为I-x(0,D-E-x(2)-[AENT]-x-[EK].

关键词：阿尔茨海默氏病、蛋白质相互作用、复杂网络、无标度网络、相互作用预测、序列模体

所属期刊栏目：42

分类号：Q615(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金30171094,30271497

在线出版日期：2008-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：479-489