基于二代测序技术探究葛根素治疗酒精性肝炎的潜在分子靶点

摘要：

目的 基于二代测序技术筛选葛根素作用于酒精性肝炎(AH)的潜在药物靶点和信号通路,探讨葛根素的作用机制.方法 将8 周龄健康雄性C57BL/6 小鼠9 只随机均分为对照组、AH组(构建AH小鼠)、葛根素组(构建AH小鼠并葛根素处理).检测各组小鼠肝功能指标.HE染色及油红O染色评估肝脏组织活动性及脂肪变性.基于二代测序技术对AH组及葛根素组进行转录组测序,采用Trimmomatic软件获取质控数据和edgeR软件识别组间差异表达基因.利用KOBAS软件进行GO分析和KEGG分析.结果 与AH组比较,葛根素组转氨酶明显降低,肝组织炎症评分及脂肪变性评分均明显下降.二代测序结果显示,AH组、葛根素组分别平均获得55 601 831个和52 934 410 个校正后短测序片段,共筛出790 个GO成功注释(生物过程574 个,分子功能141 个,细胞成分64个).两组间差异表达基因上调178 个,下调258 个,主要富集于有机酸代谢、细胞骨架的结构组成、微管.KEGG通路富集分析显示45 条通路.结论 葛根素治疗酒精性肝炎的作用靶点功能富集在有机酸代谢、细胞骨架的结构组成、微管;可能通过氨基酸代谢通路起到治疗作用.

关键词：葛根素、酒精性肝炎、二代测序、分子靶点、差异表达基因

所属期刊栏目：51

分类号：R575.1(消化系及腹部疾病)

资助基金：国家自然科学基金81570536

在线出版日期：2023-11-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：625-629